死于禽流感的女孩并没有广泛传播的变异

领导对柬埔寨南部一名11岁女孩的病毒样本进行测序的科学家说，这名女孩上周感染甲型H5N1禽流感后死亡，她携带的毒株与导致全球野生和家养鸟类大规模死亡的毒株不同。科学家们最初担心这个女孩可能感染了现在广泛传播的病毒在一些哺乳动物物种中传播自2020年以来，已经感染了少数人。

柬埔寨巴斯德研究所的病毒学家Erik Karlsson接受了记者的采访自然关于他和他的同事如何在不到一天的时间里对年轻女孩的病毒样本进行全基因组测序，然后将数据分享到公共数据库GISAID。他说，测序后的病毒属于至少10年来在该地区的鸡鸭中发现的一种病毒，尽管这名女孩是该国9年来第一个被检测出携带H5N1病毒的人。

柬埔寨卫生部对她的12名密切接触者进行了擦拭，只有她49岁的父亲检测呈阳性。H5N1感染通常发生在与家禽密切接触的人身上，到目前为止，没有证据表明这种毒株已在人与人之间传播。目前正在调查这名女孩是如何接触到病毒的。

你什么时候收到那个年轻女孩的病毒样本的?

该样本首先在金边的国家公共卫生研究所进行了检测，然后转移给了我们。我们在2月22日下午5点左右收到了样本，并在24小时内对其进行了测序。这确实证明了COVID-19大流行提高了我们快速排序和共享数据的能力。

样本中的病毒载量足够高，我们可以一次放大整个流感基因组。如果病毒载量很低，这是通常的情况，我们将不得不等待大约三天在细胞或卵子中培养它，以获得足够的病毒进行测序。我们的重点是尽快对病毒进行测序并将其公之于众。

你从这个序列中学到了什么?

该病毒属于2.3.1 c支系，是该地区的一种地方性毒株。2013年和2014年在柬埔寨造成多人感染的是同一株病毒，从那时起，在家禽中间歇性地检测到这种病毒，包括活禽市场的鸡。

每个人都很担心这个女孩可能感染了2.4.4 b病毒株，这种病毒株目前正在世界各地传播，并在欧洲、北美和南美造成了重大问题。2.3.4.4b是一种新的病毒分支，我们对它知之甚少。

研究人员对2.3.1 .1c进行了相当长一段时间的监测，掌握了相关信息，可以对其传播性和致病性做出合理判断。但任何时候发生人畜共患病外溢，我们都必须高度重视。

人畜共患病溢出效应令人担忧的是什么?

病毒，尤其是RNA病毒，如流感病毒，是极其混杂的，会很快适应一个新的宿主。我们已经在导致COVID-19的病毒身上看到了这一点。溢出表明病毒现在有机会适应新的宿主。这令人担忧，因为这种适应可能导致一种可能在人与人之间传播的病毒。在此之前，阻断任何传播的可能性，以及了解病毒在新宿主体内的活动，都是至关重要的，可以为疫情应对提供信息。

你也在给他父亲的样本测序吗?

我们正试图对父亲的样本进行测序，但他的病毒载量似乎较低，这使得快速获得序列变得有点困难。我们将尝试一些更有针对性的方法，以及隔离病毒。但通常情况下，除了部分序列，没有足够的病毒载量。

关于这个女孩是如何被感染的，我们知道些什么?

我不知道为什么在这种情况下，这种病毒在大约10年没有被发现之后，已经从家禽蔓延到人类。仍有许多因素需要调查，但由于COVID-19大流行，全球农业做法发生了许多变化，这可能为溢出效应创造了条件。

我们知道，在柬埔寨，大流行增加了后院家禽养殖的数量。许多人，比如导游，不能工作，不得不补充收入和家庭的食物来源。在世界各地，人们仍在苦苦挣扎，这导致了农业做法的改变，从而增加了外溢风险。人们健康状况的改变，例如营养不良或超重，会使人们更容易感染。

希望这是一个孤立的事件，但它可能预示着一个更大的问题。

你的团队在做什么进一步的分析?

我希望我们很快就能得到与此案有关的家禽样本的更多信息。然后我们可以将这些病毒序列与历史病毒数据进行比较，例如来自活禽市场的监测数据，来自柬埔寨这些地区的数据，看看是否有重大变化，或者是否在家禽种群中发生了一些事情迫使病毒进入，例如，更危险的表型，或对人类构成更高的风险。

我们还将在生物安全三级设施中分离和培养这种病毒，这将有助于我们开发工具，以更好地了解该病例和该病毒在该地区的流行病学。例如，我们可以在从父亲、住在女孩家中的其他人和更广泛的社区收集的样本中开发抗体的血液测试——过去感染的一个标记。这些分离物对于世界各地的实验室研究病毒的传播性和致病性也至关重要，包括在雪貂等动物模型中。