具有里程碑意义的美国国家研究院Health-funded人类微生物组计划(HMP)及其后续综合人类微生物组计划(iHMP),增加了我们理解的微生物是如何影响人类健康。这些项目映射人类微生物组,这些都是非常宝贵的,为进一步研究奠定基础和核心微生物生物标志物的发现。这项工作已经导致疾病预防和预测,和精确治疗,很可能在未来的治疗变得更为突出。

和高分子聚合物是一样强大,它生成的数据有局限性。于2007年推出,HMP一小群只有242人的基础上,从两个美国城市:密苏里州的圣路易斯,在德克萨斯州休斯顿。但我的微生物是不一样的:微生物组是由环境因素如饮食、生活方式、遗传和种族。使用微生物调查来自北美,得出结论说,一个亚洲人口可能不会工作。

来自美国和欧洲的研究人员建立了大规模队列研究,如美国的项目和荷兰微生物工程——在这些地区全面捕捉微生物组的概要文件。结果将是非常宝贵的临床研究人员在这些位置。

中国有大量的人口和多样化的饮食,文化和生活方式。这要求国家推出自己的大型队列研究映射微生物的人口。但大多数现有的人类微生物组在中国工作由中小规模的研究在特定区域和专注于肠道微生物,如广州营养和健康研究和广东肠道微生物工程。也出现了一些有趣的结果从一个全国代表性的肠道微生物研究中,这是一个小中国健康和营养调查的一部分。

组装这些研究更全面,我与西湖肠道项目(WeGut)流行病学协会1。总之,WeGut微生物数据从七组,32000名参与者覆盖17个省份和大城市中。这个大数据集可以为未来的合作和汇总分析奠定基础。WeGut也可能有助于建立一个参考肠道微生物对未来中国人口在概要文件。

WeGut框架之外,一些现有大型纵向队列研究,如中国嘉生物和上海上海妇女和男性健康研究中,已经开始收集粪便样本在后续访问肠道微生物分析。

这是进步,但它是不够的。

有技术上的限制。大多数的中国研究使用浅16 s rRNA的测序,意义缺乏大规模、更深的宏基因组数据。更好的微生物基因测序将全面概要文件和函数。

一个更严格的方法是执行微生物宏基因组测序,加上multiomics测量功能的粪便或血液。生物标志物和指纹来自肠道细菌可以指示是否在人体内的细菌是如何工作的。这种方法已经iHMP所使用的2和欧洲生命线深队列3。

有些人可能会认为,有很多炒作,只和microbiome-mapping工作报告相关,而不是因果关系。更大规模的研究,一旦与其他调查工作,将能够确定因果关系,从而使微生物研究医疗更快。

需要一个统一的努力建立“中国微生物倡议”。我建议任何此类项目是建立在三个关键点:

1。多学科的领导。科学家从流行病学、微生物学、人类遗传学、营养、生物信息学和其他相关领域需要生成一个高质量的研究协议严格的数据质量控制和管理。

2。健壮的抽样。除了收集微生物的生物样品的测量,收集所有可用的临床、医学成像、数据与参与者的饮食和生活方式是很重要的扩大更广泛的生物医学研究的项目。任何国家的调查也应该旨在从可穿戴设备记录身体活动和生理数据。这样的研究也可以链接到医疗记录。数据必须来自大量的参与者,具有代表性的人口和依赖于每个参与者的知情同意。

3所示。透明的数据共享。一个预定义的共享策略和保护数据是必要的,以帮助促进更广泛地使用数据的研究中国社会内部和外部。

当然,这个计划不会是免费的,可能需要一个专门的资金来源。但微生物是新的医学前沿,和中国是落后的理解众多的细菌在其众多的人。国家可以不创建一个中国微生物项目?