跳到主要内容gydF4y2Ba

感谢您访问nature.com。您使用的是对CSS支持有限的浏览器版本。为了获得最好的体验,我们建议您使用最新的浏览器(或关闭Internet Explorer的兼容性模式)。同时,为了确保持续的支持,我们将在没有样式和JavaScript的情况下显示站点。gydF4y2Ba

内着丝粒CCAN复合物组装到着丝粒核小体上的结构gydF4y2Ba

摘要gydF4y2Ba

在真核生物中,精确的染色体分离在有丝分裂和减数分裂维持基因组的稳定性和防止非整倍体。着丝粒是一种大型蛋白质复合物,通过组装到专门的Cenp-A核小体上gydF4y2Ba1gydF4y2Ba,gydF4y2Ba2gydF4y2Ba,功能连接着丝粒染色质和有丝分裂纺锤体的微管gydF4y2Ba3.gydF4y2Ba,gydF4y2Ba4gydF4y2Ba.脊椎动物染色体的着丝粒由数百万个DNA碱基对组成,并连接到多个微管上,而出芽酵母的简单点着丝粒连接到单个微管上gydF4y2Ba5gydF4y2Ba,gydF4y2Ba6gydF4y2Ba.所有16个出芽酵母染色体使用一个Cenp-A核小体(Cenp-A)组装完整的着丝粒gydF4y2BaNucgydF4y2Ba),每一个都完美地位于同源着丝粒上gydF4y2Ba7gydF4y2Ba,gydF4y2Ba8gydF4y2Ba,gydF4y2Ba9gydF4y2Ba.内部和外部的着丝点模块分别负责与着丝粒染色质和微管的相互作用。在这里,我们描述的冷冻电子显微镜结构gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2Ba内着丝粒模块,构成性着丝粒相关网络(CCAN)复合体,组装到Cenp-A核小体(CCAN - Cenp-A)上gydF4y2BaNucgydF4y2Ba).该结构解释了CCAN的组成亚复合物的相互依赖性,并显示了CCAN的y型开口如何容纳Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba使特定的CCAN亚基与核小体DNA和组蛋白亚基接触。与Cenp-A两端未包裹DNA双工的相互作用gydF4y2BaNucgydF4y2Ba主要由Cenp-L-Cenp-N亚复合体中的dna结合槽介导。破坏这些相互作用会损害CCAN在Cenp-A上的组装gydF4y2BaNucgydF4y2Ba.我们的数据表明了CCAN识别Cenp-A核小体的机制,以及CCAN如何作为外着丝粒组装的平台,将着丝粒连接到有丝分裂纺锤体,以进行染色体分离。gydF4y2Ba

这是订阅内容的预览,gydF4y2Ba通过你所在的机构访问gydF4y2Ba

相关的文章gydF4y2Ba

引用本文的开放获取文章。gydF4y2Ba

访问选项gydF4y2Ba

买条gydF4y2Ba

在ReadCube上获得时间限制或全文访问。gydF4y2Ba

32.00美元gydF4y2Ba

所有价格均为净价格。gydF4y2Ba

图1:结构gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaCCAN复杂。gydF4y2Ba
图2:结构gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaCCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba复杂。gydF4y2Ba
图3:Cenp-LN与Cenp-A未包裹的DNA双工相互作用gydF4y2BaNucgydF4y2Ba.gydF4y2Ba
图4:稳定的CCAN-Cenp-A需要Cenp-N dna结合槽gydF4y2BaNucgydF4y2Ba交互。gydF4y2Ba

数据可用性gydF4y2Ba

电子显微镜图已存入电子显微镜数据库,并附有登录代码gydF4y2Baemd - 4580gydF4y2Ba(CCAN),gydF4y2Baemd - 4579gydF4y2Ba(CCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba),gydF4y2Baemd - 4581gydF4y2Ba(mask1)和gydF4y2Baemd - 4971gydF4y2Ba(mask2)。蛋白质坐标已存入PDB,并附有登录代码gydF4y2Ba6 qlegydF4y2Ba(CCAN),gydF4y2Ba6昆士兰gydF4y2Ba(CCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba),gydF4y2Ba6 qlfgydF4y2Ba(mask1)。xml - ms原始文件、相关输出和数据库已通过PRIDE合作伙伴存储库通过ProteomeXchange Consortium保存,并带有数据集标识符gydF4y2BaPXD013769gydF4y2Ba.其他资料可根据合理要求提供。gydF4y2Ba

参考文献gydF4y2Ba

  1. Earnshaw, W. C. & Rothfield, N.利用硬皮病患者的自身免疫血清鉴定人类着丝粒蛋白家族。gydF4y2BaChromosomagydF4y2Ba91gydF4y2Ba, 313-321(1985)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  2. Meluh, P. B., Yang, P., Glowczewski, L., Koshland, D. & Smith, m.m.gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2Ba.gydF4y2Ba细胞gydF4y2Ba94gydF4y2Ba, 607-613(1998)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  3. 奶酪,i.m.着丝粒。gydF4y2Ba冷泉港。教谕。医学杂志gydF4y2Ba.gydF4y2Ba6gydF4y2Ba, a015826(2014)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  4. Musacchio, A. & Desai, A.着丝粒组装和功能的分子观点。gydF4y2Ba生物学gydF4y2Ba6gydF4y2Ba, 5(2017)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  5. 陈志伟,陈志伟,陈志伟,等。酵母着丝粒的分离与功能小环状染色体的构建。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba287gydF4y2Ba, 504-509(1980)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  6. Winey等人。三维超微结构分析gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2Ba有丝分裂纺锤体。gydF4y2BaJ.细胞生物学gydF4y2Ba.gydF4y2Ba129gydF4y2Ba, 1601-1615(1995)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  7. Furuyama, S. & Biggins, S.着丝粒身份是由出芽酵母中的单个着丝粒核小体指定的。gydF4y2Ba国家科学院学报美国gydF4y2Ba104gydF4y2Ba, 14706-14711(2007)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  8. 卡马哈特,R.等人。Cse4是出芽酵母中一个八聚体核小体的一部分。gydF4y2Ba摩尔。细胞gydF4y2Ba35gydF4y2Ba, 794-805(2009)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  9. Lang, J., Barber, a . & Biggins, S.对着丝粒从头组装的分析揭示了CENP-T通路在出芽酵母中的关键作用。gydF4y2BaeLifegydF4y2Ba7gydF4y2Ba, e37819(2018)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  10. Hinshaw, S. M. & Harrison, S. C.芽殖酵母Ctf19c/CCAN的结构。gydF4y2BaeLifegydF4y2Ba8gydF4y2Ba, e44239(2019)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  11. 麦金利,k.l.等。CENP-L-N复合物在着丝粒-着丝粒界面的相互作用集成网络中形成了一个关键节点。gydF4y2Ba摩尔。细胞gydF4y2Ba60gydF4y2Ba, 886-898(2015)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  12. Pesenti, m.e.等人。一个由26个亚基组成的人着丝点的重构揭示了CENP-OPQUR和NDC80的协同微管结合。gydF4y2Ba分子细胞gydF4y2Ba71gydF4y2Ba, 923-939(2018)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  13. Schmitzberger, F. & Harrison, S. C. RWD结构域:由Ctf19-Mcm21复杂结构显示的着丝点结构中的一个重复模块。gydF4y2BaEMBO代表gydF4y2Ba.gydF4y2Ba13gydF4y2Ba, 216-222(2012)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  14. Dimitrova, Y. N, Jenni, S., Valverde, R., Khin, Y. & Harrison, S. C. MIND复合物的结构定义了酵母着丝粒组装的调控焦点。gydF4y2Ba细胞gydF4y2Ba167gydF4y2Ba, 1014-1027(2016)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  15. 彼得罗维奇等人。MIS12复合物的结构及其与人着丝粒CENP-C相互作用的分子基础。gydF4y2Ba细胞gydF4y2Ba167gydF4y2Ba, 1028-1040(2016)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  16. 胡,L.等。真菌CENP-H/I/K同源体的结构分析揭示了一种保守的组装机制。gydF4y2Ba核酸测定gydF4y2Ba.gydF4y2Ba47gydF4y2Ba, 468-479(2019)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  17. Pekgöz Altunkaya, G.等。CCAN组装配置复合结合界面,促进Ndc80复合物在着丝点的交联。gydF4y2Ba咕咕叫。医学杂志gydF4y2Ba.gydF4y2Ba26gydF4y2Ba, 2370-2378(2016)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  18. Guse, A., Carroll, C. W., Moree, B., Fuller, C. J. & Straight, A. F.定义染色质模板上的体外着丝粒和着丝粒组装。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba477gydF4y2Ba, 354-358(2011)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  19. Carroll, c.w., Silva, m.c., Godek, k.m., Jansen, L. E. & Straight, a.f.着丝粒组装需要CENP-N直接识别CENP-A核小体。gydF4y2Ba细胞生物学gydF4y2Ba.gydF4y2Ba11gydF4y2Ba, 896-902(2009)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  20. Carroll, c.w., Milks, K. J. & Straight, A. F. CENP-A核小体的双重识别是着丝粒组装所必需的。gydF4y2BaJ.细胞生物学gydF4y2Ba.gydF4y2Ba189gydF4y2Ba, 1143-1155(2010)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  21. 金士顿,I. J. J. S. & Singleton, M. R.芽殖酵母中着丝粒特异性核小体的生物物理特征。gydF4y2Ba生物。化学gydF4y2Ba.gydF4y2Ba286gydF4y2Ba, 4021-4026(2011)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  22. Tachiwana, H.等。含CENP-A的人中心点核小体的晶体结构。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba476gydF4y2Ba, 232-235(2011)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  23. Roulland, Y.等。CENP-A核小体的柔性末端是有丝分裂保真度所必需的。gydF4y2Ba摩尔。细胞gydF4y2Ba63gydF4y2Ba, 674-685(2016)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  24. White, C. L., Suto, R. K. & Luger, K.酵母核小体核心粒子的结构揭示了核小体间相互作用的根本变化。gydF4y2BaEMBO JgydF4y2Ba.gydF4y2Ba20.gydF4y2Ba, 5207-5218(2001)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  25. 西野,T.等人。CENP-T-W-S-X形成独特的着丝粒染色质结构,具有组蛋白样折叠。gydF4y2Ba细胞gydF4y2Ba148gydF4y2Ba, 487-501(2012)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  26. 霍农,P.等人。一种合作机制驱动着芽酵母着丝粒在CENP-A下游组装。gydF4y2BaJ.细胞生物学gydF4y2Ba.gydF4y2Ba206gydF4y2Ba, 509-524(2014)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  27. Anedchenko, E. A.等。着丝点模块Okp1gydF4y2BaCENP-QgydF4y2Ba/ Ame1gydF4y2BaCENP-UgydF4y2Ba是着丝粒组蛋白Cse4 n端修饰的阅读器gydF4y2BaCENP-AgydF4y2Ba.gydF4y2BaEMBO JgydF4y2Ba.gydF4y2Ba38gydF4y2Ba, e98991(2019)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  28. Chittori, S.等。着丝粒蛋白CENP-N识别着丝粒核小体的结构机制。gydF4y2Ba科学gydF4y2Ba359gydF4y2Ba, 339-343(2018)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  29. Pentakota, S.等人。通过CENP-N解码中心体核小体。gydF4y2BaeLifegydF4y2Ba6gydF4y2Ba, e33442(2017)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  30. 加藤,H.等。着丝粒蛋白CENP-C识别着丝粒核小体的保守机制。gydF4y2Ba科学gydF4y2Ba340gydF4y2Ba, 1110-1113(2013)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  31. Kouprina, N.等人。酵母染色体分离控制基因CHL4的鉴定与克隆。gydF4y2Ba遗传学gydF4y2Ba135gydF4y2Ba, 327-341(1993)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  32. 威尔,J. R.等。从生物化学重组到人类着丝粒结构的洞见。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba537gydF4y2Ba, 249-253(2016)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  33. 福克,S. J.等。染色体。CENP-C在着丝粒重塑并稳定CENP-A核小体。gydF4y2Ba科学gydF4y2Ba348gydF4y2Ba, 699-703(2015)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  34. 张志,杨娟,张志军,张志军。多蛋白复合物在昆虫细胞-杆状病毒表达体系中的表达与重组。gydF4y2Ba方法gydF4y2Ba95gydF4y2Ba, 13-25(2016)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  35. 用沉降速度分析超离心法分析蛋白质自结合。gydF4y2Ba分析的物化学gydF4y2Ba.gydF4y2Ba320gydF4y2Ba, 104-124(2003)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  36. 分析超离心数据的计算和出版质量插图。gydF4y2Ba方法EnzymolgydF4y2Ba.gydF4y2Ba562gydF4y2Ba, 109-133(2015)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  37. Samel, A., Cuomo, A., Bonaldi, T. & ehrenhoffer - murray, A. E. CenH3精氨酸37的甲基化调控着丝粒完整性和染色体分离。gydF4y2Ba国家科学院学报美国gydF4y2Ba109gydF4y2Ba, 9029-9034(2012)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  38. 郑世强等。MotionCor2:改进冷冻电子显微镜光束诱导运动的各向异性校正。gydF4y2BaNat方法。gydF4y2Ba14gydF4y2Ba, 331-332(2017)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  39. 张凯。Gctf:实时CTF测定与校正。gydF4y2Baj . Struct。医学杂志gydF4y2Ba.gydF4y2Ba193gydF4y2Ba, 1-12(2016)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  40. Fernandez-Leiro, R. & Scheres, s.h.w. RELION中单粒子处理的管道方法。gydF4y2BaActa Crystallogr。DgydF4y2Ba73gydF4y2Ba, 496-502(2017)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  41. Nakane, T., Kimanius, D., Lindahl, E. & Scheres, s.h.通过RELION中的多体细化来表征低温em单粒子数据中的分子运动。gydF4y2BaeLifegydF4y2Ba7gydF4y2Ba, e36861(2018)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  42. 埃尔姆伦德,H.,埃尔姆伦德,D. &本吉奥,S. PRIME:单颗粒冷冻电子显微镜的概率初始3D模型生成。gydF4y2Ba结构gydF4y2Ba21gydF4y2Ba, 1299-1306(2013)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  43. 陈,S.等。高分辨率噪声替代测量过拟合和验证分辨率在三维结构确定单粒子电子冷冻显微镜。gydF4y2BaUltramicroscopygydF4y2Ba135gydF4y2Ba, 24-35(2013)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  44. Emsley, P., Lohkamp, B., Scott, W. G. & Cowtan, K.白骨顶的特征与发育。gydF4y2BaActa Crystallogr。DgydF4y2Ba66gydF4y2Ba, 486-501(2010)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  45. 杨,Z.等。UCSF Chimera, modeleller和IMP:集成建模系统。gydF4y2Baj . Struct。医学杂志gydF4y2Ba.gydF4y2Ba179gydF4y2Ba, 269-278(2012)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  46. Schmitzberger, F.等人。通过RWD结构域-肽相互作用的内着丝粒结构的分子基础。gydF4y2BaEMBO JgydF4y2Ba.gydF4y2Ba36gydF4y2Ba, 3458-3482(2017)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  47. Iml3-Chl4异源二聚体将核心着丝粒与精确染色体分离所需的因子联系起来。gydF4y2Ba细胞代表gydF4y2Ba.gydF4y2Ba5gydF4y2Ba, 29-36(2013)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  48. Kelley, L. A., Mezulis, S., Yates, C. M., Wass, M. N. & Sternberg, M. J. Phyre2蛋白质建模、预测和分析门户网站。gydF4y2BaNat。ProtocgydF4y2Ba.gydF4y2Ba10gydF4y2Ba, 845-858(2015)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  49. Buchan, d.w., Minneci, F., Nugent, t.c., Bryson, K. & Jones, d.t. PSIPRED蛋白质分析工作台的可扩展web服务。gydF4y2Ba核酸测定gydF4y2Ba.gydF4y2Ba41gydF4y2Ba, w349-w357(2013)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  50. Luger, K, Mäder, a.w., Richmond, r.k, Sargent, d.f. & Richmond, t.j. 2.8 A分辨率下核小体核心粒子的晶体结构。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba389gydF4y2Ba, 251-260(1997)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  51. 瓦苏德万,蔡,E. Y. D.和戴维,C. A.包含“601”强定位序列的核小体核心粒子的晶体结构。gydF4y2BaJ. Mol.生物学gydF4y2Ba.gydF4y2Ba403gydF4y2Ba, 1-10(2010)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  52. 亚当斯,P. D.等。PHENIX:一个全面的基于python的大分子结构解决方案系统。gydF4y2BaActa Crystallogr。DgydF4y2Ba66gydF4y2Ba, 213-221(2010)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  53. 陈,v.b.等。MolProbity:大分子结晶学的全原子结构验证。gydF4y2BaActa Crystallogr。DgydF4y2Ba66gydF4y2Ba, 12-21(2010)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  54. 戈达德,t.d.等人。UCSF ChimeraX:迎接可视化和分析的现代挑战。gydF4y2Ba蛋白质科学gydF4y2Ba.gydF4y2Ba27gydF4y2Ba, 14-25(2018)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  55. 沃特豪斯,a.m.,普罗克特,j.b.,马丁,d.m., Clamp, M. & Barton, g.j. Jalview版本2 -一个多序列比对编辑器和分析工作台。gydF4y2Ba生物信息学gydF4y2Ba25gydF4y2Ba, 1189-1191(2009)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  56. 刘芳和赫克,A. J.用交联质谱分析蛋白质组合和蛋白质相互作用网络的结构。gydF4y2Ba咕咕叫。当今。结构体。医学杂志gydF4y2Ba.gydF4y2Ba35gydF4y2Ba, 100-108(2015)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  57. Liu, F., Lössl, P., Scheltema, R., Viner, R. & Heck, A. J. R.用于全蛋白质组交联鉴定的优化碎片方案和数据分析策略。gydF4y2BaNat。CommungydF4y2Ba.gydF4y2Ba8gydF4y2Ba, 15473(2017)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  58. Grimm, M., Zimniak, T., Kahraman, a . & Herzog, F. xVis:用于交联派生空间约束的示意图可视化和解释的web服务器。gydF4y2Ba核酸测定gydF4y2Ba.gydF4y2Ba43gydF4y2Ba, w362-w369(2015)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  59. Vizcaíno, J. A.等。ProteomeXchange提供全球协调的蛋白质组学数据提交和传播。gydF4y2BaNat。gydF4y2Ba.gydF4y2Ba32gydF4y2Ba, 223-226(2014)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  60. 闫凯,张震,杨杰,McLaughlin, s.h.和Barford, D.出芽酵母着丝粒cbf3 -着丝粒复合物的结构。gydF4y2BaNat。结构。摩尔。杂志gydF4y2Ba.gydF4y2Ba25gydF4y2Ba, 1103-1110(2018)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  61. 欣肖,S. M.达茨,A. N. &哈里森,S. C.酵母Ctf3复合物的结构。gydF4y2BaeLifegydF4y2Ba8gydF4y2Ba, e48215(2019)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  62. Akiyoshi, B.等人。张力直接稳定再造的动丝-微管附件。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba468gydF4y2Ba, 576-579(2010)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  63. Gonen, S.等。纯化的着丝粒结构显示有多个微管附着位点。gydF4y2BaNat。结构。摩尔。杂志gydF4y2Ba.gydF4y2Ba19gydF4y2Ba, 925-929(2012)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba公共医学中心gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

下载参考gydF4y2Ba

确认gydF4y2Ba

这项工作由MRC拨款(MC_UP_1201/6)和CRUK拨款(C576/A14109)资助给D.B,地平线2020计划INFRAIA项目Epic-XS (project 823839)资助给A.J.R.H.,德意志Forschungsgemeinschaft (EH237/12-1)资助给a.e.e.m。我们感谢LMB、eBIC、剑桥大学和利兹电子显微镜设备在电子显微镜数据收集方面的帮助,感谢S. Scheres在电子显微镜处理方面的帮助,感谢Barford小组的成员进行了有益的讨论,感谢J. Grimmett和T. Darling在计算方面的帮助,感谢J. Shi在昆虫细胞表达方面的帮助。gydF4y2Ba

审核人信息gydF4y2Ba

自然gydF4y2Ba感谢Eva Nogales和其他匿名审稿人对这项工作的同行评审所做的贡献。gydF4y2Ba

作者信息gydF4y2Ba

作者及隶属关系gydF4y2Ba

作者gydF4y2Ba

贡献gydF4y2Ba

z.z克隆的着丝点和核小体结构。J.Y.和Z.Z.纯化蛋白,进行蛋白复合物重建和生化遗传分析。K.Y.和L.C.制备了低温em网格,收集和分析了电子显微镜数据,并确定了CCAN−Cenp-A的三维重建gydF4y2BaNucgydF4y2Ba和免费的Cenp-HIK。D.B.和K.Y.拟合坐标并建立模型,J.Y.和S.H.M.进行SEC-MALS和分析超离心。D.F.收集并分析了XL-MS数据。A.J.R.H.指导了XL-MS实验和分析。A.E.E.-M。生成了gydF4y2Bachl4Δcse4-R37AgydF4y2Ba而且gydF4y2Bachl4ΔgydF4y2Ba酵母菌株。D.B.指导了这个项目。K.Y.和D.B.在所有作者的帮助下完成了手稿。gydF4y2Ba

相应的作者gydF4y2Ba

对应到gydF4y2Ba大卫BarfordgydF4y2Ba.gydF4y2Ba

道德声明gydF4y2Ba

相互竞争的利益gydF4y2Ba

作者声明没有利益竞争。gydF4y2Ba

额外的信息gydF4y2Ba

出版商的注意gydF4y2Ba施普林格自然对出版的地图和机构从属关系中的管辖权主张保持中立。gydF4y2Ba

扩展的数据图形和表格gydF4y2Ba

扩展数据图1重构gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaCCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba复合物。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba, (i) CCAN, (ii) CCAN - Cenp-A核小体(Widom 601)配合物,(iii) Cenp-A核小体(Widom 601), (iv) H3核小体(Widom 601)和(v) H3的尺寸排除色谱谱(Agilent Bio SEC-5柱)gydF4y2BaNgydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba(与widom601)。gydF4y2BabgydF4y2Ba, CCAN-Cenp-A的比较尺寸排除色谱剖面(Agilent Bio SEC-5柱)gydF4y2BaNucgydF4y2BaCenp-A核小体包裹有(i) 147 bp的Widom 601定位序列(CCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba(Widom 601)gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba)或(ii) 153bpgydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2Ba着丝粒gydF4y2BaCen3gydF4y2Ba序列(CCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba(gydF4y2BaCen3gydF4y2Ba))。两种配合物以相同的体积洗脱。CCAN和H3核小体不形成复合物(iii)。gydF4y2BacgydF4y2Ba14亚基CCAN复合物的考马斯蓝染色SDS-PAGE。gydF4y2BadgydF4y2Ba, Cenp-A考马斯蓝染色SDS-PAGE凝胶gydF4y2BaNucgydF4y2Ba(601年Widom教授)。Lane E32,分数32的溴化乙锭染色凝胶。gydF4y2BaegydF4y2Ba, CCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba(widom601)复杂。Lane E13,溴化乙锭染色凝胶,分数13。尺寸排除色谱图示于gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba.gydF4y2BafgydF4y2Ba, CCAN和H3核小体SDS-PAGE凝胶(Widom 601) SEC运行如图所示gydF4y2BabgydF4y2Ba.gydF4y2BaggydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BajgydF4y2Ba,考马斯蓝染色SDS-PAGE凝胶与Cenp-TW共表达,并在标记的Cenp-I亚基(*)上用双链标记纯化。gydF4y2BajgydF4y2Ba, Cenp-TW (Cenp-TgydF4y2BaHFDgydF4y2BaW)与Cenp-HIK交互gydF4y2Ba头gydF4y2Ba.这些结果证实了我们的低温电镜图中Cenp-H, K和I亚基的分配。gydF4y2BakgydF4y2Ba, CCAN-Cenp-A的组织示意图gydF4y2BaNucgydF4y2Ba亚基和亚复合物以及与外着丝粒Mis12和Ndc80复合物的连接。线表示亚复杂连接。连接Cenp-A的两条通路gydF4y2BaNucgydF4y2Ba连接到Ndc80复合体和微管的蛋白分别为P1和P2(粗线连接到Ndc80)。必需P1通路的亚基标记为黑色,并用蓝色阴影表示,而非必需P2通路的亚基标记为白色,并用黄色阴影表示。当P1通路因Dsn1磷酸化缺陷而出现缺陷时,P2通路就变得必不可少gydF4y2Ba9gydF4y2Ba.在gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BajgydF4y2Ba分别进行了三次独立试验,结果相似。凝胶源数据参见补充图。gydF4y2Ba1gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

扩展数据图2gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaCCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba复杂。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba, CCAN-Cenp-A的典型冷冻电子显微照片gydF4y2BaNucgydF4y2Ba,代表9,002张显微照片。gydF4y2BabgydF4y2Ba, CCAN二维类图库,代表100个二维类。gydF4y2BacgydF4y2Ba, CCAN-Cenp-A的2D类图库gydF4y2BaNucgydF4y2Ba,代表150个2D类。c2对称(CCAN)的2D类平均gydF4y2Ba2gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba在c2 -对称轴平面上观察的复合物用红色标出。只有少数视图被观察到,排除了3D重建。低温电镜网格部分破坏了CCAN-Cenp-A的稳定gydF4y2BaNucgydF4y2Ba相互作用,导致(CCAN)的丰度非常低gydF4y2Ba2gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba颗粒(约占总量的0.03%)。(CCAN)的双对称轴gydF4y2Ba2gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba复合体显示为虚线箭头。数据的实验gydF4y2BabgydF4y2Ba而且gydF4y2BacgydF4y2Ba独立试验12次,结果相似。gydF4y2BadgydF4y2Ba, CCAN-Cenp-A的冷冻电镜重建FSC曲线gydF4y2BaNucgydF4y2Ba复合物:apo-CCAN, mask1 (Cenp-OPQU+, Cenp-LN), mask2 (Cenp-HIK, Cenp-LN, sub-Cenp-OP), CCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba.中定义了用于MBR的Mask1和mask2gydF4y2BahgydF4y2Ba而且gydF4y2Ba我gydF4y2Ba和方法。gydF4y2BaegydF4y2Ba, CCAN-Cenp-A的Angular分布图gydF4y2BaNucgydF4y2Ba粒子。gydF4y2BafgydF4y2Ba, CCAN的局部分辨率图。gydF4y2BaggydF4y2Ba, CCAN-Cenp-A的局部分辨率图gydF4y2BaNucgydF4y2Ba.gydF4y2BahgydF4y2Ba, mask1的局部分辨率图(Cenp-OPQU+, Cenp-LN)。gydF4y2Ba我gydF4y2Ba, mask2的局部分辨率图(Cenp-HIK, Cenp-LN, sub-Cenp-OP)。gydF4y2Ba

图3 CCAN-Cenp-A三维分类工作流程gydF4y2BaNucgydF4y2Ba低温电子显微镜数据集。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba在最初的2D分类后,约140万个粒子被3D分类为apo-CCAN(52%)和CCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba复杂的(48%)。对于apo-CCAN, 4%以二聚体形式存在(黑箱),19%显示有序头基(Cenp-HIK)gydF4y2Ba头gydF4y2Ba)为Cenp-HIK-TW亚复合体(蓝框)。在CCAN-Cenp-A上应用掩码gydF4y2BaNucgydF4y2Ba低温电镜图以排除结构变量Cenp-HIKgydF4y2Ba头gydF4y2Ba域用于重建4.15 Å结构。gydF4y2BabgydF4y2Ba, MBR使用的四种掩模的详细信息。gydF4y2BacgydF4y2Ba,一个小型的3D类CCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba,揭示了附着在Cenp-HIK上的密度gydF4y2Ba头gydF4y2Ba与Cenp-A的DNA环流接触gydF4y2BaNucgydF4y2Ba被分配为Cenp-TgydF4y2BaHFDgydF4y2BaW。gydF4y2Ba

图4 apo-CCAN的低温电镜密度图。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba, Cenp-H和Cenp-K卷曲线圈的部分冷冻- em图。中定义的高度保守的亚基间残基的选择gydF4y2BabgydF4y2Ba而且gydF4y2BacgydF4y2Ba贴上标签。这些残基在低温电镜密度中被很好地定义,与结构一致。gydF4y2BabgydF4y2Ba,gydF4y2BacgydF4y2Ba, Cenp-H卷曲线圈区域的多序列比对(gydF4y2BabgydF4y2Ba)及Cenp-K (gydF4y2BacgydF4y2Ba).gydF4y2BadgydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BafgydF4y2Ba, Cenp-LN部分低温电磁图(gydF4y2BadgydF4y2Ba)、Cenp-I (gydF4y2BaegydF4y2Ba)和Nkp1-Nkp2 (gydF4y2BafgydF4y2Ba).该结构中Cenp-H、Cenp-I和Cenp-K的链位和极性与酵母Ctf3 (PDB: 6OUA)的冷冻电镜结构一致。gydF4y2Ba61gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

图5 CCAN和CCAN - cenp - a的Cryo-EM密度gydF4y2BaNucgydF4y2Ba复合物。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba, CCAN-Cenp-A的低温电镜重建gydF4y2BaNucgydF4y2Ba从未交联的样本,在8.6 Å分辨率。gydF4y2BabgydF4y2Ba,二聚体CCAN的Cryo-EM图(也扩展数据图)。gydF4y2Ba3gydF4y2Ba,黑匣子)。如图所示,子单元用颜色编码。gydF4y2Ba1gydF4y2Ba.3.5 Å单体自由CCAN坐标被刚体对接到冷冻em地图中。gydF4y2BacgydF4y2Ba,卡通代表的gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2Ba思想复杂gydF4y2Ba15gydF4y2Ba(右),显示出与CENP-OPQU+(左)的Cenp-QU-Nkp1-Nkp2的卷曲线圈显著相似。gydF4y2BadgydF4y2Ba,免费Cenp-HIK的4.7 Å分辨率冷冻- em地图,并配有CCAN的拟合坐标。gydF4y2BaegydF4y2Ba,在CCAN的背景下,Cenp-HIKgydF4y2Ba头gydF4y2Ba旋转以适应Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba.Cenp-HIK的两种构象来自apo-CCAN和CCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba在Cenp-HIK的刚性部分上叠加配合物(apo-CCAN显示Cenp-I的c端区域),表明Cenp-HIK构象的可变性gydF4y2Ba头gydF4y2Ba在两个州之间。Cenp-HIK的亚基gydF4y2Ba头gydF4y2Ba的CCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba都是浅色的。gydF4y2BafgydF4y2Ba, Cenp-A的Cryo-EM密度gydF4y2BaNucgydF4y2Ba显示了Cenp-C的Cenp-C基序。gydF4y2Ba

图6 CCAN和CCAN - cenp - a的XL-MS分析gydF4y2BaNucgydF4y2Ba复合物。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba,gydF4y2BabgydF4y2Ba,圆形图显示所有已识别的CCAN交联(gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba)和CCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba(gydF4y2BabgydF4y2Ba).亚基间和亚基内交联分别用红色和蓝色表示gydF4y2BacgydF4y2Ba,gydF4y2BadgydF4y2Ba,直方图显示C .gydF4y2BaαgydF4y2Ba- cgydF4y2BaαgydF4y2Ba可映射到CCAN上的交联的距离分布(gydF4y2BacgydF4y2Ba)和CCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba结构(gydF4y2BadgydF4y2Ba).95%的映射交联满足交联器施加的距离限制30 Å,用红色虚线表示。gydF4y2BaegydF4y2Ba,gydF4y2BafgydF4y2Ba,映射到CCAN的交联(gydF4y2BaegydF4y2Ba)和CCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba复杂(gydF4y2BafgydF4y2Ba).亚基间和亚基内交联分别用红色和蓝色表示。超过交联器施加的距离限制30 Å的交联以黄色表示。gydF4y2BaggydF4y2Ba,在CCAN结构上通过XL-MS显示与Cenp-C交联的残基。红色球体,CCAN-Cenp-A的交联gydF4y2BaNucgydF4y2Ba复杂;黄色球体,apo-CCAN特有的额外交联。在gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba而且gydF4y2BabgydF4y2Ba分别进行了三次独立试验,结果相似。gydF4y2Ba

扩展数据图7gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaCenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba核小体被打开。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BacgydF4y2Ba, Cenp-LN亚复合物dna结合槽的正电荷静电势守恒gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2Ba,gydF4y2Ba美国非洲酒gydF4y2Ba而且gydF4y2Ba智人gydF4y2Ba.gydF4y2Ba美国非洲酒gydF4y2Ba而且gydF4y2Ba智人gydF4y2Ba由建模结构表示。gydF4y2BadgydF4y2Ba, Cenp-N与之相互作用gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaCenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba在CCAN的背景下,不同于自由人类Cenp-N与Cenp-A的相互作用gydF4y2BaNucgydF4y2Ba.人Cenp-N - cenp - a核小体结构的Cenp-N亚基(PDB: 6C0WgydF4y2Ba29gydF4y2Ba的Cenp-N上gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaCCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba结构。在Cenp-N-Cenp-A模式下gydF4y2BaNucgydF4y2Ba交互,Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba会与CCAN的Cenp-OPQU+和Cenp-N发生冲突。gydF4y2BaegydF4y2Ba,gydF4y2BafgydF4y2Ba,结构gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaH3gydF4y2BaNucgydF4y2Baid3 (PDB: 1gydF4y2Ba24gydF4y2Ba) (gydF4y2BaegydF4y2Ba)和Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba(gydF4y2BafgydF4y2Ba,这工作)。gydF4y2BaggydF4y2Ba的n端区域序列对齐gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaH3和Cenp-A (Cse4)组蛋白。对于嵌合物H3gydF4y2BaNgydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba,残差1-50gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaH3取代了1-140的残基gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaCenp-A。类似的方法被用于脊椎动物Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba(ref。gydF4y2Ba23gydF4y2Ba).gydF4y2Ba

扩展数据图8 CCAN SDS-PAGEgydF4y2BaΔCenp-CgydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba复合物。gydF4y2Ba

对应的排除尺寸色谱图如图所示。gydF4y2Ba4 bgydF4y2Ba和扩展数据图。gydF4y2Ba9gydF4y2Ba.gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba,gydF4y2BabgydF4y2Ba突变Cenp-N dna结合槽不会损害CCANgydF4y2BaΔCenp-CgydF4y2Ba组装。gydF4y2BacgydF4y2Ba,野生型CCANgydF4y2BaΔCenp-CgydF4y2Ba与Cenp-A形成复合体gydF4y2BaNucgydF4y2Ba.gydF4y2BadgydF4y2Ba突变Cenp-N dna结合槽可破坏CCANgydF4y2BaΔCenp-CgydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba交互。gydF4y2BaegydF4y2BaCenp-A L1环的突变并没有使CCAN失稳gydF4y2BaΔCenp-CgydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba交互。gydF4y2BafgydF4y2Ba, Cenp-A N端缺失(1-129)(gydF4y2BaΔNgydF4y2BaCenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba)不损害CCANgydF4y2BaΔCenp-CgydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba交互。gydF4y2BahgydF4y2Ba,都是CCANgydF4y2BaΔCenp-CgydF4y2Ba和CCANgydF4y2BaΔCenp-CgydF4y2Ba-Cenp-NgydF4y2Ba无足轻重的人gydF4y2Ba与H3结合不良gydF4y2BaNgydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba.所显示的实验是独立进行的,重复三次,结果相似。凝胶源数据参见补充图。gydF4y2Ba1gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

扩展数据图9 CCAN测试gydF4y2BaΔCenp-CgydF4y2Ba与Cenp-A结合gydF4y2BaNucgydF4y2Ba.gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba,野生型CCAN的比较SEC剖面(Agilent Bio SEC-5列)gydF4y2BaΔCenp-CgydF4y2Ba和Cenp-NgydF4y2Ba无足轻重的人gydF4y2Ba的CCANgydF4y2BaΔCenp-CgydF4y2Ba对Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba及其修饰物(Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Bal1gydF4y2BaNucgydF4y2Ba,gydF4y2BaΔNgydF4y2BaCenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba和H3gydF4y2BaNgydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba)及H3gydF4y2BaNucgydF4y2Ba.L1环突变(Cenp-AgydF4y2BaL1gydF4y2Ba-gydF4y2BaNucgydF4y2Ba)或删除n端129残基(gydF4y2BaΔNgydF4y2BaCenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba)并没有破坏CCAN的稳定gydF4y2BaΔCenp-CgydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba交互。相比之下,CCAN与Cenp-NgydF4y2Ba无足轻重的人gydF4y2Ba结合不太好和CCAN和CCAN - cenp - ngydF4y2Ba无足轻重的人gydF4y2Ba几乎不与H3结合gydF4y2BaNgydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba.(CCANgydF4y2BaΔCgydF4y2Ba, CCANgydF4y2BaΔCenp-CgydF4y2Ba).相关的SDS-PAGE见扩展数据图。gydF4y2Ba8gydF4y2Ba,gydF4y2Ba9 bgydF4y2Ba).gydF4y2BabgydF4y2Ba,考马斯蓝染色SDS-PAGE显示CCANgydF4y2BaΔCenp-CgydF4y2Ba与H3无关gydF4y2BaNucgydF4y2Ba.gydF4y2BacgydF4y2Ba,微球菌核酸酶消化Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba, H3gydF4y2BaNucgydF4y2Ba和H3gydF4y2BaNgydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba.widom601 DNA显示为对照。H3的gydF4y2BaNucgydF4y2Ba和H3gydF4y2BaNgydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba与Cenp-A相比,其保护的DNA长度相似且更长gydF4y2BaNucgydF4y2Ba.gydF4y2BadgydF4y2BaCBF3型号gydF4y2Ba60gydF4y2Ba与CCAN-Cenp-A结合gydF4y2BaNucgydF4y2Ba,表明CBF3不会与完全组装的着丝点相关联,这与蛋白质组学数据一致gydF4y2Ba62gydF4y2Ba.在gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BacgydF4y2Ba分别进行了三次独立试验,结果相似。凝胶源数据参见补充图。gydF4y2Ba1gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

扩展数据图10gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaCCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba在溶液中包含两个CCAN配合物。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BacgydF4y2Ba, (CCAN)的预测质量gydF4y2Ba2gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba为1.31 MDa, (CCAN)gydF4y2Ba1gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2BaMDa为0.77,CCAN二聚体MDa为1.09(扩展数据表gydF4y2Ba2gydF4y2Ba).交联的代表性SEC-MALS数据gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaCCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba复杂(gydF4y2Ba一)gydF4y2Ba,结果相似,平均分子质量为1.23 MDa ((CCAN)gydF4y2Ba2gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba);uncrosslinkedgydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaCCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba复杂(gydF4y2BabgydF4y2Ba),独立进行三次试验,结果相似,平均MDa质量为1.38 ((CCAN)gydF4y2Ba2gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba)和526 kDa (CCAN);而且gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2Ba单独CCAN (gydF4y2BacgydF4y2Ba),结果相似,前缘(绿色)平均质量为839 kDa,后缘(洋红色)平均质量为650 kDa,表明存在未分解的单体-二聚体平衡。gydF4y2BadgydF4y2Ba,gydF4y2BaegydF4y2Ba、交联的速度分析超离心(gydF4y2BadgydF4y2Ba)和非交联(gydF4y2BaegydF4y2Ba)gydF4y2Ba酿酒酵母gydF4y2BaCCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba所示配合的残差复合体gydF4y2BafgydF4y2Ba而且gydF4y2BaggydF4y2Ba.gydF4y2BafgydF4y2Ba,gydF4y2BaggydF4y2Ba,适合gydF4y2BacgydF4y2Ba(gydF4y2Ba年代gydF4y2Ba)交联复合体(gydF4y2BafgydF4y2Ba),主要沉积物种类位于15.8S (gydF4y2Ba年代gydF4y2Baw, 20gydF4y2Ba= 26.1S),次要种为12.1S (gydF4y2Ba年代gydF4y2Baw, 20gydF4y2Ba= 20.0S),对应的计算质量为1.34 MDa ((CCAN)gydF4y2Ba2gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba)和896 kDa(可能(CCAN)gydF4y2Ba1gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba),摩擦比拟合值为1.761。gydF4y2BaggydF4y2Ba,对于未交联的样品,主要种分解为两个种,沉积时间为14.3S (gydF4y2Ba年代gydF4y2Baw, 20gydF4y2Ba= 22.6S)及15.7S (gydF4y2Ba年代gydF4y2Baw, 20gydF4y2Ba= 24.9S),次要种为12.3S (gydF4y2Ba年代gydF4y2Baw, 20gydF4y2Ba= 19.4 S),其质量为1.32 MDa ((CCAN)gydF4y2Ba2gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba)和1.15 MDa ((CCAN)gydF4y2Ba2gydF4y2Ba)及716 kDa ((CCAN)gydF4y2Ba1gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba)。在gydF4y2BadgydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BaggydF4y2Ba分别进行了三次独立试验,结果相似。gydF4y2BahgydF4y2Ba,两个2D类平均值的例子,显示(CCAN)gydF4y2Ba2gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba在C2对称轴平面上观察的粒子(红色轮廓)(数据来自扩展数据图。gydF4y2Ba2摄氏度gydF4y2Ba)和模型的二维重投影(CCAN)gydF4y2Ba2gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba基于CCAN-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba低温电镜重建(黄色轮廓)(如图所示gydF4y2Ba我)gydF4y2Ba.计算的重投影与观测到的二维类在形状和尺寸上有密切的对应关系。(CCAN)的双对称轴gydF4y2Ba2gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba复合体显示为虚线箭头。gydF4y2Ba我gydF4y2Ba,gydF4y2BajgydF4y2Ba关于CCAN如何组装到Cenp-A核小体上将与外着丝体-微管界面相互作用的两种替代模型(补充视频)gydF4y2Ba2gydF4y2Ba).gydF4y2Ba我gydF4y2Ba在场景(1)中,CCAN与外着丝粒从与dna结合面同一侧相互作用。附着在外着丝粒上的微管将从上面的核小体和伸展的DNA下面升起CCAN。gydF4y2BajgydF4y2Ba在场景(2)中,微管-外着丝点界面从相对的一侧接触到CCAN dna结合表面。着丝点外(outer-KT): KMN网络和微管附着复合物,Dam1-DASH(出芽酵母)和脊椎动物的Ska蛋白。(CCAN)的组合维数gydF4y2Ba2gydF4y2Ba-Cenp-AgydF4y2BaNucgydF4y2Ba(32纳米)与酵母着丝粒中心的轮毂相匹配gydF4y2Ba63gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

扩展数据表1 Cryo-EM数据收集、改进和验证统计gydF4y2Ba
扩展数据表2 CCAN子单元表gydF4y2Ba

补充信息gydF4y2Ba

补充图1gydF4y2Ba

电泳分离得到的所有数据的原始源图像:考马斯蓝染色和溴化乙锭染色的SDS PAGE和western blots染色和溴化乙锭染色的琼脂糖凝胶gydF4y2Ba

报告总结gydF4y2Ba

补充表1gydF4y2Ba

载脂蛋白CCAN交联质谱数据。列出了交联赖氨酸残基gydF4y2Ba

补充表2gydF4y2Ba

CCAN-Cenp-A的交联质谱数据gydF4y2BaNucgydF4y2Ba.列出了交联赖氨酸残基gydF4y2Ba

视频1gydF4y2Ba

CCAN-Cenp-A的低温电镜密度图gydF4y2BaNucgydF4y2Ba如图所示,首先没有密度Cenp-HIKgydF4y2Ba头gydF4y2Ba.接下来,CCAN-Cenp-A的密度图gydF4y2BaNucgydF4y2Ba与Cenp-HIKgydF4y2Ba头gydF4y2Ba显示的是gydF4y2Ba

视频2gydF4y2Ba

二聚体CCAN在Cenp-A上组装的模型gydF4y2BaNucgydF4y2Ba.CCAN-Cenp-A的两种情况gydF4y2BaNucgydF4y2Ba表示可能附着在外层着丝点上(扩展数据图10i, j)gydF4y2Ba

权利和权限gydF4y2Ba

转载及权限gydF4y2Ba

关于本文gydF4y2Ba

通过CrossMark验证货币和真实性gydF4y2Ba

引用本文gydF4y2Ba

严K,杨J,张Z。gydF4y2Baet al。gydF4y2Ba内着丝粒CCAN复合物组装到着丝粒核小体上的结构。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba574gydF4y2Ba, 278-282(2019)。https://doi.org/10.1038/s41586-019-1609-1gydF4y2Ba

下载引用gydF4y2Ba

  • 收到了gydF4y2Ba:gydF4y2Ba

  • 接受gydF4y2Ba:gydF4y2Ba

  • 发表gydF4y2Ba:gydF4y2Ba

  • 发行日期gydF4y2Ba:gydF4y2Ba

  • DOIgydF4y2Ba:gydF4y2Bahttps://doi.org/10.1038/s41586-019-1609-1gydF4y2Ba

这篇文章被引用gydF4y2Ba

评论gydF4y2Ba

通过提交评论,您同意遵守我们的gydF4y2Ba条款gydF4y2Ba而且gydF4y2Ba社区指导原则gydF4y2Ba.如果您发现一些滥用或不符合我们的条款或指导方针,请标记为不适当。gydF4y2Ba

搜索gydF4y2Ba

快速链接gydF4y2Ba

自然简报gydF4y2Ba

报名参加gydF4y2Ba自然简报gydF4y2Ba时事通讯-什么重要的科学,免费到您的收件箱每天。gydF4y2Ba

获取当天最重要的科学故事,免费在您的收件箱。gydF4y2Ba 注册《自然简报》gydF4y2Ba
Baidu
map