东西来在药物设计的形状

2018年2月27日

脂蛋白是必不可少的组件外细胞膜的细菌和细菌生活中扮演重要的角色。这些复杂的结构由蛋白质和脂质合成了三种酶在细胞膜内抗生素的研发科学家认为可能是潜在目标。现在,一个国际研究小组描述了结构的最终合成过程中的酶,Lnt,启示可能引导开发新的抗生素。

团队,由马丁·凯弗雷的爱尔兰的都柏林三一学院,Lnt从细菌物种的结构决定的铜绿假单胞菌和大肠杆菌,这两个人类病原体。Lnt结构在两个物种极其相似,凯弗雷说,即使很小的差异可能被利用来开发特有的抗生素。

由团队透露,Lnt描述的结构是由八个气缸固定在细胞内膜及其活性部位,进行反应的一部分,位于外膜。“这是意外的发现活性部位远离膜,让我们问基板如何访问它,”凯弗雷说。“答案出来的结构本身,因为我们看到这些伸出手臂扩展从活性部位和本质上提供一个坡道从飞机上膜的网站。”

这种布局符合Lnt被认为是如何工作的,“乒乓”机制,脂质和lipoprotiens排队进入活动网站,与产品的反应轮下底物进入离开前的活性部位。突变的蛋白质不能进行的反应使团队直接想象这个队列。“我们看到这些将脂质分子活性位点的蛋白质排列得很整齐,”凯弗雷回忆说。

尽管它的细节,仅仅知道这对指导新药设计结构是不够的。脂蛋白是公认的“外国身份证”我们的免疫系统。药物阻止Lnt与脂蛋白的交互也可能影响我们的免疫反应。而复杂的结构形成的免疫蛋白和脂蛋白是已知的,研究人员不知道Lnt-lipoprotein复杂本身的样子。“如果我们能得到这些,他们也有不同之处,我希望,我们将能够利用这种差异为目标,基于结构的药物设计,是有选择性的,理想情况下,没有非目标效应,”凯弗雷说。

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引用

1. 自然通讯8日,15952 (2017)。doi:10.1038 / ncomms15952