博士后在森林metatranscriptomics UPSC / SLU

博士后是可用的沃恩匆忙的研究小组的森林遗传学和植物生理学(瑞典农业科学大学)的一部分于植物科学中心。

最后一天申请:2023年4月30日

项目描述

北方森林碳储存和骑自行车是由复杂的树木和土壤微生物之间的相互作用。DNA测序技术的进步提供了前所未有的视图到这些复杂的微生物群落,但现有方法限制我们的能力来预测环境条件的变化如何改变这些协会和他们提供的至关重要的生态系统服务。我们最近开发了一种metatranscriptomic分析管道样本收集从一个成熟的挪威云杉森林了季节性解决转录组相关联的挪威云杉根和350多根真菌物种(https://doi.org/10.1073/pnas.2118852119)。这种方法使我们能够链接的功能响应寄主树木改变养分有效性,与深刻的扰动真菌社区。我们的目标是将这种方法应用到其他森林类型和设置开发更全面的了解这些森林,和他们的微生物群,可能适应未来气候条件。

职责

计划和实施RNA-Seq的转录组分析收集的数据字段取样根成熟的欧洲赤松和挪威云杉树,和耦合metatranscriptomics真菌有关社区的分析,随后又准备相关的手稿。

资格

积极性高、具团队精神的候选人经验证明在植物和/或真菌生物信息学。资格,现任应该有相关学科博士学位的位置,如真菌学或微生物学相关plant-microbe交互,植物分子遗传学和植物生物化学。记录生物信息学技能是必不可少的,候选人应该有经验的下一代测序数据的分析,使用高性能计算机基础设施运行分析,解释微分表达式的结果分析,都有良好的记录驾驶通过出版这样的项目。证明了知识和经验与分析植物与生物的互动合作伙伴将是非常可取的。此外,经验与相关公众数据库在基因组学和分子生物学知识和良好的统计数据,例如假设检验和富集分析将是一个资产。良好的知识和技能,至少有一个相关的编程或脚本语言,例如R、Java、Python或至关重要的经验计算模型co-expression网络和本体(特别是基因本体)的生物通路注释的知识和经验与机器学习方法的应用分析转录组数据。优秀的英语沟通和写作能力是必不可少的。

作为博士后任命为初级研究人员的发展状况,我们主要是寻找候选人的博士学位最多三岁。

文凭必须书面或翻译成英语或瑞典得到确认。

应用程序

请通过SLU的招聘系统申请以下这个链接和使用按钮“应用”:https://www.slu.se/en/about-slu/work-at-slu/jobs-vacancies/?rmpage=job&rmjob=p8260

不晚于我们欢迎您的应用程序2023-04-30。

开始日期:2023-08-01或根据协议

联系

的问题,请联系沃恩快点vaughan.hurry@slu.se。

研究环境

森林遗传学和植物生理学的一部分于植物科学中心(UPSC)这是一个卓越中心实验装置研究和森林生物技术在瑞典北部。我们的使命是提供优质和创新的基础研究和生成知识效益林业、农业、环境和社会。我们工作在一个广泛的学科从细胞生物学生态生理学和植物科学达到从基础研究到工业应用。我们共同的目标是了解植物的生长能力、适应和适应不断变化的世界,我们如何更好的植物品种。

UPSC属于两所大学,瑞典农业科学大学(SLU)和于默奥大学。大约有200人从40多个不同民族在这里工作。我们举办一些30主要调查人员,我们的研究人员获得先进的分析平台,独特的树种质资源和植物生长设施。我们争取一个协作的工作环境并支持我们的科学家在所有的职业生涯阶段通过提供专业的培训机会和个人的职业生涯指导。

期刊有很强的博士后Umea博士后社区组织协会(UPS)。UPS在博士后培养网络,组织社会和职业发展活动和工作对提高博士后经验于默奥。看看他们的网站:https://umeapostdocsociety.se/,毫不犹豫地与他们取得了联系!

关于SLU

SLU是一个世界级的国际大学与研究、教育和环境评估在科学可持续的生活。其主要场所Alnarp乌米亚和乌普萨拉,但活动也进行了研究,实验在瑞典公园和教育机构。我们汇集的人有不同的观点,但他们都有一个同样的目标:创造一个可持续发展的最好的条件,繁荣和更美好的世界。

SLU刚刚超过3000名员工,5000名学生和30亿克朗周转率。吸引大量投资于现代大学校园环境。阅读更多关于我们的福利,这就像在SLU工作https://www.slu.se/en/about-slu/work-at-slu/