单细胞的核心

哈佛医学院空间转录组学副主任

自2016年成立以来，单细胞核心(鳞状细胞癌)在哈佛医学院(HMS)在许多重大发现中发挥了重要作用HMS社区通过提供最先进的单细胞基因组学分析的设计和执行的专家建议和访问。为了扩大这一核心的产品，并继续提供获得单细胞和转录组学方法的最新前沿进展的途径鳞状细胞癌正在寻找一名空间转录组学副主任，他将负责将鳞状细胞癌最近和新颖的方法，空间解析转录组学和指导他们的使用HMS社区。

单细胞基因组学方法，如单细胞核糖核酸测序，已经成为解决广泛的生物学问题不可或缺和强大的工具，从基础发育生物学到疾病表型和途径发现。然而，在捕获和表征之前所需的细胞分离在很大程度上抛弃了关于组织内细胞和细胞内分子(如rna)的空间组织的重要信息。反过来，这种空间环境对于理解许多生物学问题是必不可少的。

在过去的几年里，出现了一套空间转录组学技术，旨在保留或恢复基因组尺度测量中的这一关键空间背景。这些技术结合了多种方法，从空间捕获方法——其中空间排列的条形码被纳入核糖核酸在这种方法中，从完整细胞和组织中的单个分子中产生独特的荧光条形码，这些条形码用于识别和定位数百到数千种不同的rna。这些技术与空间捕获方法具有互补优势，前者提供表达rna的非靶向测量，但分辨率和灵敏度适中;后者基于图像的方法提供亚细胞分辨率，具有高灵敏度，但只提供靶向rna集。新的方法不断被引入，早期的技术现在已经商业化。令人兴奋的是，这些新兴的技术套件有望在广泛的系统和问题上取得新的生物学突破。

职位概要

空间转录组学副主任(AD)将负责为成员提供关键的空间转录组学技术HMS社区通过鳞状细胞癌．该AD的任务是获得空间捕获方法(visium和Stereo-seq)以及领先的基于图像的方法(merfish)的深入工作知识，并利用这些经验为该组织的成员提供指导HMS实验设计，不同样品类型的制备，测量优化，空间数据解释和分析的社区。该主任还将负责保持这一快速发展领域的工作知识，并指导未来空间转录组学技术的采用鳞状细胞癌．广告将加入动态团队鳞状细胞癌并协调这些努力鳞状细胞癌主任及职员。

利用空间转录组学的嵌入式专业知识HMS在美国，这则广告将在杰弗里·莫菲特博士(Jeffrey Moffitt)的实验室进行培训MERFISH空间转录组学领域的新兴领导者，并将从核心主任、核心员工和该项目创始人Allon Klein博士那里获得额外的科学指导、培训和支持鳞状细胞癌也是单细胞基因组学的领导者。

主要职责:

·配合总监管理公司的日常运营和长期战略鳞状细胞癌．

·就如何使用商业和内部技术设计和进行成功的空间转录组学实验与广泛的研究小组进行咨询。

·亲身实践空间转录组学实验，从样本处理到数据分布。

·对新的空间转录组学应用进行实验评估，以确定它们是否适合纳入鳞状细胞癌．

·对当地生物医学研究界进行培训和推广

·在地方、国家和国际会议上介绍核心工作成果。

·记录和沟通结果和进展鳞状细胞癌科学顾问委员会。

·监督/指导员工和学生基本的实验室技术。

·与测序和生物信息学核心合作进行分析和故障排除。

职位要求

除了希望在单细胞转录组学的前沿领域工作外，合格的候选人还应该具备

分子生物学，遗传学，生物化学，细胞生物学，生物工程，生物物理学或其他相关领域的博士学位，至少1年相关研究领域的经验(博士后经验计算)。

清楚地了解基本的分子生物学技术(例如:DNA/核糖核酸净化、聚合酶链反应/ RT -聚合酶链反应在显微镜(如光学显微镜，免疫荧光等)和细胞或组织生物学(如组织培养或组织学等)方面有一定经验

●良好的团队合作能力

优秀的组织能力和细节意识

较强的沟通和人际交往能力

建议要求

在以下任何领域的经验将是有益的，但不是必需的

熟悉R或Python环境下的基因组数据分析，包括但不限于Seurat或Scanpy中的单细胞分析

●单细胞基因组数据收集，包括10X Chromium等平台

●RNA原位杂交方法，如单分子荧光原位杂交(鱼)或RNAscope

组织切片相关的制备方法，包括冷冻切片或包埋福尔马林固定石蜡切片(FFPE)样品

●空间转录组学方法，包括空间捕获方法，如Visium或GeoMx，或基于图像的方法，如MERFISH

均等就业机会声明

我们是一个机会均等的雇主，所有符合条件的申请人都将获得就业考虑，而不考虑种族，肤色，宗教，性别，国籍，残疾状况，受保护的退伍军人身份，性别认同，性取向，怀孕和怀孕相关的状况，或任何其他受法律保护的特征。

请将简历及求职信发送至Mandovi_Chatterjee@hms.harvard.edu并在主题行中提到职位#P0025393。