NIHR曼彻斯特生物医学研究中心四年制博士研究生
癌症生物标志物中心核酸生物标志物组
Dominic Rothwell, Simon Pearce, Caroline Dive, Natalie Cook, Alicia Conway
“液体活检提高未知癌症的诊断和治疗
主(杯)”
癌症原发原因不明(杯)是一组异质性转移性肿瘤，其标准化诊断工作无法在诊断时确定起源部位。这方面缺乏研究杯唯一被批准的治疗方法是化疗。在英国，它仍然是导致癌症死亡的第五大原因。
大规模分子分析研究杯表明高达30%的患者有潜在的可操作的基因组改变，可以接受靶向治疗。然而，缺乏原始组织(太)的指定严重限制了患者的治疗选择杯目前大多数患者都采用“一刀切”的化疗方法，治疗效果有限。
我们的目标是为患有杯通过对他们的血液进行分子分析，并确定可操作的分子变化。由于获得高质量的组织进行分子分析仍然是一个重大的挑战杯，我们的重点是液体活检方法。我们开发了一个健壮、敏感和可重复的全基因组-无循环DNA(cfDNA)甲基化分析方法(T7-MBD-seq)(例如Chemi等人，2022)，并进一步开发了我们的工作流程，以生成高度特异性的机器学习起源组织(太)用于原发肿瘤的分类器。我们将这种液体活检应用于一组患有杯在概念验证研究中。我们的初步工作揭示了通常预测的肿瘤类型杯现在需要进一步的描述。
在这个博士项目中，学生将优化和部署我们的太液体活检扩展和验证cfDNA分子分析的潜在临床应用，从单次抽血患者杯．他们将结合基因突变和拷贝数分析与太在更大的患者队列中的预测杯．改进我们的原型ctDNA甲基化太多模式方法的分类和开发将提高我们识别患者的能力，在这种难以治疗的癌症群体中，可以重新分类和潜在地分层到替代疗法，以及进一步表征潜在的“有利”亚型杯这可以被划分为更好的治疗方法。该项目提供了一个在临床未满足需求的领域工作的机会，使用新颖的液体活检技术，并与专家生物信息学团队一起开发核心生物信息学技能。
如有非正式查询，请致电Dominic Rothwell医生或Alicia Marie Conway医生dominic.rothwell@cruk.manchester.ac.uk或alicia-marie.conway@cruk.manchester.ac.uk
有兴趣的学生可以在网站上找到入学标准和如何申请的详细信息CRUK曼彻斯特学院网站:
https://www.cruk.manchester.ac.uk/Education/PhD-2023-Apply
申请截止日期:2023年12月9日(星期五)下午17时(格林尼治时间）.
面试日期:2023年2月17日星期二，柴郡奥尔德利公园。
