我们的任务是了解人类基因组中非编码转录的起源和功能，重点是长非编码rna和增强子rna。我们一直在使用大规模的内部转录组数据集(例如。幽灵财团)。我们还将我们的内部数据集与公共表观基因组和遗传(例如。GWAS和eQTL)数据集，以深入了解非编码rna在人类疾病中的作用。我们的团队主要由专门从事转录组学的生物信息学分析师组成，但我们正与实验生物学家密切合作，为技术开发(如单细胞转录组学)提供生物信息学支持，并参与其他合作项目(如人类细胞图谱)。我们的研究主要集中在以下几个方面:1)整合遗传数据与群体规模的单细胞和大量转录组/表观基因组数据(即。GWAS和eQTL)以深入了解人类疾病，特别是自身免疫性疾病;2）在体外在人群规模上使用患者来源的iPSC建模神经退行性疾病;3)肿瘤转录组和体细胞突变的队列规模单细胞分析;
成功的候选人将负责分析由神经退行性变、自身免疫性疾病或癌症队列产生的人群规模的单细胞转录组和表观基因组数据集。这些分析包括但不限于无监督细胞聚类，细胞类型注释，单细胞eQTL，细胞类型特异性富集GWAS信号，基因共表达网络等等。这些项目突出了基因数据与单细胞的整合核糖核酸seq /ATAC-Seq数据识别跨细胞类型的活性功能性非编码元件，目的是1)阐明非编码元件在疾病中的作用，2)促进解释人类疾病易感性中非编码变异的因果关系。预计候选人将应用最先进的单细胞组学和遗传学的计算和统计方法，构建个性化(基于遗传变异)基因调控网络，最终为未来的精准医疗提供指导。鼓励对单细胞组学、人类遗传学、神经退行性变和自身免疫性疾病感兴趣的候选人申请。
这个职位的主要隶属机构是广岛大学生命综合科学研究生院。成功的候选人也将附属于日本中西医结合中心基因组信息分析实验室客座研究员。定期往返于东广岛大学和广岛之间日本预计将在横滨举行。