红色收割蚂蚁 收获蚁生活在沙漠草原上,以种子为食。蜂群通过调节外出和返回觅食者之间的嗅觉相互作用来管理水分压力。在新墨西哥州进行的一项长期研究表明,这种集体行为在干旱条件下是如何演变的。 黛博拉·m·戈登 这个月 2022年11月03日
EQIPD框架严格要求动物实验的设计、进行、分析和记录 EQIPD动物实验严密性框架旨在统一当前建议,并在多中心动物实验中对其可行性进行了前瞻性测试。 Jan Vollert 马尔科姆·麦克劳德 安德鲁·s·c·赖斯 评论 2022年9月5日
Patch-seq把神经科学带到了一个多模态的地方 Patch-seq将形态学、电生理学和转录组数据传递给那些有技巧、耐心和毅力的人。 薇薇安马克思 集合: NatureTech 技术特性 2022年11月03日
神经科学理论的数据科学未来 一种整合丰富的异质大脑数据的方法——从基因表达和神经递质受体密度到结构和功能——允许神经科学家轻松地将他们的数据置于更广泛的神经科学背景中。 布拉德利教 新闻及观点 2022年10月6日
一种标记染色质相关rna的原位方法 RNA是真核生物染色质的重要组成部分,但识别和绘制RNA的技术非常繁琐。我们采用了现有的基于标记的分析技术,使染色质相关rna在一个简单的工作流程中进行分析,增强了识别调控rna的能力。 研究简报 10月3日
Light-Seq:从显微镜到转录组,然后返回 Light-Seq将高分辨率成像与固定生物样本中选定细胞群的下一代测序相结合。具体来说,显微镜下分析的细胞可以进行RNA表达谱分析,同时保持样品完整,以供进一步分析,使细胞表型和状态能够在原始组织的背景下进行评估。 研究简报 10月17日
使荧光显微镜的分辨率翻倍 光片荧光显微镜(LSFM)与结构照明的组合比LSFM单独的分辨率提高了一倍。我们展示了一个使用单一物镜进行照明和荧光检测的实际实现,并演示了其用于快速体积成像。 研究简报 2022年10月24日
幼体斑马鱼大脑神经回路的自动突触级重建 本资源提供了整个幼虫斑马鱼大脑的串行块面EM数据集,包括神经元的自动分割,突触的检测和视觉运动处理电路的重建。 费边Svara 多米尼克•福斯特 赫韦格Baier 资源 开放获取 2022年10月24日
SyConn2:用于体积电子显微镜的致密突触连通性推断 SyConn2是一个基于机器学习的框架,用于推断和分析大脑组织的体积电子显微镜数据集中包含的连接体,例如来自斑胸草雀。 菲利普·j·舒伯特 斯文Dorkenwald Joergen Kornfeld 简短的沟通 开放获取 2022年10月24日
一种多用途、可再生、蛋白质组规模的人类磷丝氨酸资源 迭代合成磷酸化异构体(iSPI)是一个蛋白质组规模的人类来源的含磷酸丝氨酸磷酸肽库,具有精确的磷酸化位置。这种多用途资源可用于磷蛋白组学工作流程中关键步骤的优化、标准化和基准测试。 Brandon M. Gassaway 李嘉明 史蒂文·p·吉吉 简短的沟通 2022年10月24日
改进的AlphaFold模型与隐式实验信息 本文提出了一种迭代过程,在实验密度图的基础上自动重建AlphaFold模型,并将重建的模型用作新的AlphaFold预测的模板。 托马斯·c·特威利格 潘国强 保罗·d·亚当斯 文章 开放获取 10月20日
通过抗体靶向标记原位分析染色质靶点上的RNA 这项工作展示了RT&Tag,它在完整的细胞核中捕获了感兴趣的蛋白质附近的RNA分子。 娜迪亚Khyzha 史蒂文Henikoff 神灵艾哈迈德 文章 开放获取 10月3日
Light-Seq:固定细胞和组织中生物分子的光定向原位条形码,用于空间索引测序 Light-Seq在固定细胞和组织中使用光定向DNA条形码进行多路空间索引和随后的下一代测序。这种方法混合了空间和组学信息,能够分析复杂组织中的罕见细胞类型。 Jocelyn Y. Kishi nin刘 彭殷 文章 开放获取 10月10日
ClampFISH 2.0实现了快速、可扩展的扩增RNA原位检测 ClampFISH 2.0可在RNA FISH中实现高度特异性的多路信号放大。该方法用于检测10种RNA,这些RNA在超过100万个细胞中分布丰富,也适用于组织切片。 伊恩Dardani 本杰明·埃默特 Arjun拉吉 文章 2022年10月24日
用STELLAR注释空间分辨率单细胞数据 STELLAR(空间细胞学习)是一种几何深度学习模型,它与空间解析单细胞数据集一起工作,既可以根据参考数据集在无注释数据集中分配细胞类型,又可以发现新的细胞类型。 玛丽亚Brbić 凯迪曹 法律上Leskovec 文章 2022年10月24日
通过斜平面结构照明的光片显微镜分辨率加倍 结合光片照明的光学切片和多向结构照明显微镜的分辨率的长期目标是通过斜平面显微镜实现改进的快速3D亚细胞成像。 肚子陈 Bo-Jui常 Reto P. Fiolka 文章 2022年10月24日
将图像形成过程整合到深度学习中可以提高网络性能 Richardson-Lucy Network (RLN)将传统的Richardson-Lucy迭代与深度学习相结合,以改进反褶积。RLN比其他方法更一般化,提供更少的工件,需要更少的计算时间。 李越 苏皮 哈里钱币兑换商 文章 开放获取 2022年10月31日
Omnipose:用于细菌细胞分割的高精度形态学独立解决方案 Omnipose是一种用于图像分割的深度神经网络算法,通过解决从任何模态获取的图像中精确分割形态多样的细胞这一具有挑战性的问题,改进了现有的方法。 凯文·j·卡特勒 Carsen斯金格 Joseph D. Mougous 文章 开放获取 10月17日
在培养皿中增强器官发生的类器官培养的几何工程 具有几何重构培养系统的可扩展平台,用于类器官的长期生长和成熟。 Sunghee Estelle Park 肖恩·康 Dan donggeun Huh 文章 2022年10月24日
敏感的基因编码传感器的群体和亚细胞成像cAMP在体内 cAMPFIREs是基因编码的cAMP传感器,适用于cAMP信号的体内成像,如中所示果蝇幼虫和行为正常的老鼠。 克里斯汀·i·马森吉尔 兰登Bayless-Edwards 海宁钟 文章 10月27日